Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RFT1Q96AA3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFT1Q96AA3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms