Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM63Q969Q1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM63Q969Q1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM63Q969Q1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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