Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJA10Q969M2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GJA10Q969M2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJA10Q969M2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GJA10Q969M2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GJA10Q969M2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJA10Q969M2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms