Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNFRSF25Q93038 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFRSF25Q93038 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFRSF25Q93038 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms