Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERCC4Q92889 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERCC4Q92889 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC4Q92889 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms