Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KIFAP3Q92845 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFAP3Q92845 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms