Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPDL3AQ92484 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3AQ92484 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms