Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf54Q8WWF1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1orf54Q8WWF1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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