Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBR1Q8WVP7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMBR1Q8WVP7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms