Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP133Q8WUM0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP133Q8WUM0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP133Q8WUM0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP133Q8WUM0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms