Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC12Q8WUD4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC12Q8WUD4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC12Q8WUD4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms