Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf43Q8TAL5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf43Q8TAL5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf43Q8TAL5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms