Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45GIP1Q8TAE8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45GIP1Q8TAE8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GADD45GIP1Q8TAE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1Q8TAE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1Q8TAE8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms