Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP61Q8NHU2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP61Q8NHU2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP61Q8NHU2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms