Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA6DQ8NFY4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA6DQ8NFY4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA6DQ8NFY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms