Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC148Q8NFR7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC148Q8NFR7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC148Q8NFR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms