Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APPL2Q8NEU8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL2Q8NEU8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APPL2Q8NEU8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL2Q8NEU8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms