Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF548Q8NEK5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF548Q8NEK5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms