Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MSANTD4Q8NCY6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSANTD4Q8NCY6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSANTD4Q8NCY6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD4Q8NCY6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD4Q8NCY6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD4Q8NCY6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD4Q8NCY6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD4Q8NCY6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD4Q8NCY6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSANTD4Q8NCY6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms