Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COLGALT1Q8NBJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COLGALT1Q8NBJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COLGALT1Q8NBJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms