Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLRC2Q8NBF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms