Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX3Q8N9I9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX3Q8N9I9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX3Q8N9I9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX3Q8N9I9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX3Q8N9I9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DTX3Q8N9I9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DTX3Q8N9I9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DTX3Q8N9I9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms