Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRACR2BQ8N4Y2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRACR2BQ8N4Y2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms