Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP4Q8N3C7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLIP4Q8N3C7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIP4Q8N3C7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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