Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC43Q8N309 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC43Q8N309 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC43Q8N309 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC43Q8N309 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms