Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00528Q8N1L1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00528Q8N1L1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00528Q8N1L1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1565 ms