Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFT20Q8IY31 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT20Q8IY31 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT20Q8IY31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms