Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC117Q8IWD4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC117Q8IWD4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms