Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APLFQ8IW19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APLFQ8IW19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APLFQ8IW19 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms