Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A9Q8IVM8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A9Q8IVM8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A9Q8IVM8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms