Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERC1Q8IUD2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERC1Q8IUD2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERC1Q8IUD2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ERC1Q8IUD2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERC1Q8IUD2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERC1Q8IUD2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms