Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSIG1Q86XK7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VSIG1Q86XK7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms