Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIBP1Q86W92 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP1Q86W92 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms