Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PACS2Q86VP3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PACS2Q86VP3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACS2Q86VP3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms