Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00523Q86TU6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00523Q86TU6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00523Q86TU6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms