Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRGAP1Q7Z6B7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP1Q7Z6B7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP1Q7Z6B7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms