Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMC6Q7Z403 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC6Q7Z403 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms