Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ZFYVE16Q7Z3T8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
ZFYVE16Q7Z3T8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ZFYVE16Q7Z3T8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZFYVE16Q7Z3T8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZFYVE16Q7Z3T8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms