Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCXQ7RTU7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms