Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2AQ7L0J3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SV2AQ7L0J3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SV2AQ7L0J3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SV2AQ7L0J3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms