Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27LQ71UM5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27LQ71UM5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS27LQ71UM5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS27LQ71UM5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS27LQ71UM5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS27LQ71UM5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS27LQ71UM5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms