Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP50Q70EL3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP50Q70EL3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP50Q70EL3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP50Q70EL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms