Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM179Q6ZVK1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM179Q6ZVK1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM179Q6ZVK1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms