Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC149Q6ZUS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC149Q6ZUS6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC149Q6ZUS6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms