Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPGS1Q6ZTW0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPGS1Q6ZTW0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPGS1Q6ZTW0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms