Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf47Q6ZRZ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf47Q6ZRZ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf47Q6ZRZ4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms