Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLCO4C1Q6ZQN7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO4C1Q6ZQN7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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