Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBP6Q6ZN66 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP6Q6ZN66 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP6Q6ZN66 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms