Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HACD2Q6Y1H2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD2Q6Y1H2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD2Q6Y1H2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms