Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD4Q6W3E5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDPD4Q6W3E5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD4Q6W3E5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms